보건의료기술육성기본계획에 따른 보건의료기술 정부 R&D 투자는 3년간 총 3조원 규모로 정부 전체 국가연구개발사업의 5.6%, 보건의료 분야 연구개발사업의 74.7%의 비중을 차지하고 있다. 이 중 보건복지부, 舊 미래창조과학부, 산업통상자원부가 약 85%를 투자한 것으로 나타났다.

질환별 투자결과를 보면 3년 동안 신생물 분야에 전체 금액 중 14.1%인 4237억원이 투자되었고, 그 외 신경계통의 질환(6%, 1804억원), 순환계통의 질환(5.5%, 1644억원), 내분비, 영양 및 대사질환(5.2%, 1580억원), 근골격계통의 질환(4.5%, 1357억원), 특정 감염성 및 기생충성 질환(4.2%, 1259억원), 호흡계통의 질환(3.6%, 1091억원), 소화계통의 질환(3.2%, 976억원) 등의 순으로 나타났다.

연구행위에 따른 투자 분석 결과, 치료법 분야에 31.9%인 9606억원을 투자하였고, 그 외 기반연구(20.7%, 6249억원), 진단법 개발(11.5%, 3482억원), 질병예방 및 건강증진(8.7%, 2621억원), 병인규명 (6.6%, 1994억원), 질병 및 건강상태 관리(3.6%, 1082억원), 안전관리 연구(3.3%, 997억원), 보건복지서비스 연구 (1.1%, 331억원) 등의 순이었다.

산출물별로는 합성 의약품(2391억원, 치료법 개발), 보건의료 자원 및 인프라(2230억원, 기반연구), 생물학 및 내인성 요인(1698억원, 병인규명) 등에 투자된 것으로 나타났다.

보건의료 분야 사회적 부담 측정 지표들과 연구개발 투자 지표를 비교한 결과, 사망원인 질환에 대한 보건의료기술 R&D 투자는 3년간(2013~2015) 악성신생물 2437억원, 심장질환 565억원, 뇌혈관 질환 252억원, 폐렴 49억원, 당뇨병 945억원, 만성하기도 질환 250억원, 간질환 192억원, 고혈압성 질환 102억원 등으로 나타났다.